Para você realizar a baixa agrupada dentro do sistema pode estar acessando a tela do financeiro no ($ na aba superior) ou clicando AQUI
Nisso irá identificar os títulos que deseja realizar a baixa múltipla, e selecionar pela checkbox na esquerda da tela do financeiro, e por fim em Ações -> Baixa múltipla:
E assim conseguirá colocar uma conta bancária, forma pagamento/recebimento, nº documento, data de pagamento/recebimento. E finalizando em confirmar baixa.
Sendo confirmada a baixa irá aparecer que foi criado um novo título de baixa agrupada no canto direito superior:
Pesquisando com a data de pagamento, ou pelo título desejado ele irá aparecer na sua pesquisa a baixa realizada :D
Qualquer dúvida, pode nos chamar no chat.