Para fazer o cancelamento da nota fiscal, você vai em NFE:
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Depois de localizar a nota a ser cancelada, na mesma linha dela você vai clicar em AÇÕES -> CANCELAR

Na justificativa você vai colocar um texto de no MÍNIMO 15 CARACTERES, depois clicar em CANCELAR.
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Você terá certeza de que a nota está cancelada quando o status dela não estiver mais AUTORIZADA na verde, mas sim na como CANCELADA na cor cinza, conforme a imagem a seguir:

É importante você saber o prazo legal de cancelamento de notas fiscais autorizadas no seu Estado, para você conferir o seu é só clicar AQUI.

Dúvidas, ficamos à disposição